Este programa ofrece altos niveles de homologación (>95%), reconociendo en las carreras de traspaso de la Universidad Santo Tomás, las asignaturas cursadas y aprobadas. Esto significa que, cumpliendo con todos los requisitos académicos, los y las estudiantes de Bachillerato en Ciencias ingresan al segundo año de la carrera de destino.

El Bachillerato en Ciencias de la Universidad Santo Tomás es un programa académico flexible de 4 semestres, que entrega a las y los estudiantes una sólida formación básica, valórica y cultural, potenciando sus capacidades de análisis y de reflexión. Al término del programa, y dependiendo de las carreras que se imparten en las sedes donde se ofrece el Bachillerato, las y los estudiantes podrán elegir de manera informada y responsable una carrera para continuar sus estudios, a partir de las opciones que la Universidad ofrece en las sedes de Antofagasta y Santiago, entre las cuales están: Agronomía, Biotecnología, Ciencias del Deporte y Actividad Física, Contador Público y Auditor, Enfermería, Fonoaudiología, Kinesiología, Ingeniería Civil Industrial, Ingeniería Comercial, Ingeniería de Información en Control de Gestión, Geología, Medicina Veterinaria, Nutrición y Dietética, Tecnología Médica o Terapia Ocupacional.